耶鲁大学创建的一种新的病理学工具利用条形码技术，显示出在癌症诊断中使用的潜力。发表在《细胞》杂志上的一项新研究讨论了这项名为Patho DBiT（组织中的病理兼容确定性条形码）的技术。通讯作者Mina Xu，医学博士，病理学和实验医学教授，耶鲁癌症中心（YCC）成员，YSM血液病理学主任，分享了她对新工具的热情。徐说：“作为一名诊断癌症的医生，我很惊讶使用这种病理工具能看到更多的东西。”。
“我认为这种深入的分子潜水将成倍地推进我们对肿瘤生物学的理解。我真的很期待提供更精确和可操作的诊断。”Patho-DBiT使用DNA条形码来绘制RNA和蛋白质的空间关系，从而能够对RNA进行全面检查（某些类型在癌症中具有调节作用）。该技术的独特之处在于，它具有从两个方向将条形码传递到组织中的微流体装置，创建了一个独特的二维像素“马赛克”，提供了可用于指导创建患者特异性靶向治疗的空间信息。
该技术由耶鲁大学Rong Fan博士的实验室创建，现已授权给耶鲁大学分拆出来的AtlasXomics。“这是我们第一次在临床组织样本中直接‘看到’各种RNA物种，包括它们的位置和作用，”YSM生物医学工程和病理学教授、该研究的高级作者、YCC成员范说。“使用这个工具，我们能够更好地了解每个RNA分子的迷人生物学，除了知道每个基因是否表达外，它还有非常丰富的生命周期。
我认为这将彻底改变我们未来研究人类生物学的方式。”在该研究的手稿中，研究人员解释了为什么他们的工具Patho DBiT可能是解锁实验室组织活检样本中保存的“丰富信息”的关键。该研究的第一作者、范实验室的博士后研究员白志亮博士说：“有数百万种这样的组织已经存档了这么多年，但到目前为止，我们还没有有效的工具在空间层面对其进行研究。
我们正在研究的这些组织中的RNA分子高度碎片化，传统方法无法捕捉到有关它们的所有重要信息。这就是为什么我们对Patho DBiT非常兴奋。”Patho DBiT的未来潜在用途包括创建靶向疗法，并帮助了解从低级别肿瘤转变为更具侵袭性肿瘤的机制，以找到预防方法。研究人员表示，为了将Patho DBiT纳入病理诊断，需要进行更多的研究来测试和验证患者样本。
这项多学科研究包括耶鲁大学几个系的教员，包括生物医学工程、病理学和遗传学。陆军，博士，遗传学副教授，加入范，白，徐作为耶鲁大学的合著者。卢说：“Patho-DBiT-seq还能够生成非编码RNA表达的空间图，这非常令人兴奋。非编码RNA通常存在于我们基因组中以前被认为是垃圾DNA的区域，但现在它们被认为是癌症等生物学和疾病中的宝贵角色。”