即使飓风的即时洪水威胁消失后，居民仍可能面临因水而带来的一系列潜在健康问题——以及水所留下的东西。洪水不只是雨水。它通常受到污水、细菌和化学物质的污染。金属或玻璃制成的锋利物体也可能隐藏在浑浊的水中。根据环境学家维尔玛·苏布拉的说法，暴露于被污水污染的洪水中会刺激皮肤，导致疖子或皮疹，特别是身体某些部位如果长时间浸泡在其中。
虽然与洪水的短暂皮肤接触不应该成为问题，但即使是一个小伤口或擦伤也可能成为有害细菌和病毒的入口。洪水中的化学物质还可能在接触后引起皮疹和灼伤皮肤和眼睛。洪水引起的疾病
洪水可以携带疾病。世界卫生组织指出，在那些霍乱、伤寒或黄热病等疾病存在的发展中国家，这是一个长期问题。不过，这些疾病在美国并不常见，因此这种疫情爆发的可能性很低。
在美国，更常见的是在人们接触被污染的洪水或吃喝被污染的食物后出现腹泻和其他胃部问题。据美国疾病控制和预防中心（CDC）说，洪水可以污染饮用水，特别是私人井水。在与洪水接触后，需要对这些井进行测试。对于市政供水，州和地方卫生部门将建议是否需要煮沸或处理水后再使用。使用被洪水浸泡过的物品也会引起胃部问题。
为了防止儿童生病，CDC强烈建议家长不要让孩子玩被水浸泡过的玩具，除非已经用一盎司漂白剂——大约1/8杯——在2加仑水中消毒。多项研究表明，暴露于洪水中会增加人们患耳、鼻和喉疾病的风险，不过世界卫生组织指出，这些问题大多数是个别病例，不会变成疫情。世界卫生组织称，在1970年至1994年间的14次重大洪水中，唯一一次主要的腹泻病疫情发生在1980年的苏丹。
在与大群体密切接触的人中，偶尔的胃病或呼吸道感染可能更常见。在洪水条件下，人们很难保持健康的卫生标准，而且当人们在庇护所与大群体呆在一起时，很容易传播细菌。CDC建议住在庇护所的人们要特别小心，经常洗手或使用酒精基的洗手液以防止疾病传播。与健康相关的清理挑战
医生常在洪水退去并允许人们回到家中后看到更多的呼吸道感染。
在像佛罗里达或乔治亚这样温暖的环境中，洪水的污染和迅速生长的霉菌可以加重哮喘或引发过敏。CDC建议在清理房屋时穿橡胶靴和手套，避免直接接触任何被洪水浸泡过的物品。专家还建议戴上口罩或呼吸器。如果洪水进入房屋，应尽快将其晾干以防止霉菌生长。如果雨停了，打开窗户和门以加快这一过程。如果有电，可以使用除湿机，还可以在门窗放置风扇将空气吹出去而不是向内吹，以免传播霉菌。
接触洪水的墙壁、地板以及任何有硬表面的物品——如家电、台面或儿童游戏区——需要用肥皂和水清洁，并用漂白剂溶液消毒。如果需要更换或修复墙壁或地板，美国环保署表示，所有物品都需要彻底清洁和晾干以防止霉菌生长。织物应该用热水清洗或干洗。可以保存的家具如床、软垫沙发和椅子应该在阳光下晾干，然后喷上消毒剂。地毯应该用蒸汽清洁。与洪水接触过的食品和饮料应扔掉。
美国食品和药物管理局建议人们也扔掉那些即使在原装容器中或带螺旋盖的处方药，因为如果与污染水接触过，它们可能已不再安全。静止水的风险：动物和触电
洪水通常会冲走蚊子并中断其繁殖周期，但当水退去后，感染蚊媒疾病如西尼罗河病毒或寨卡病毒的风险增加。一项2019年的研究表明，蚊子在静止水中繁殖迅速。卡特里娜飓风后，直接受影响的地区西尼罗河病毒的病例急剧增加。
CDC建议在静止水附近工作或生活的人们要特别注意使用含有DEET或派卡丁的驱虫喷雾。外出时，即使天气温暖，也要穿长袖、长裤和袜子以防止蚊子叮咬。蚊子并不是暴风雨后唯一需要担心的昆虫——甚至也不是唯一需要担心的动物。当蛇因洪水而流离失所时，它们常常会寻找比平常更靠近人类的避难所和食物。受洪水损坏的建筑物可能吸引蛇，因为它们更容易进入并藏在废墟下。
野生动物专家建议穿高度至少10英寸的防蛇靴，人们在清理废墟时如果可能应从顶部抓取废物，而不是将手指放在下面。其他可能被洪水驱逐的生物包括蚂蚁、啮齿动物、蜘蛛、爬行动物、鳄鱼甚至是家中的宠物。CDC建议尽量保持距离以避免被咬伤。由于倒下的电力线或地下但仍带电的电线被浸泡在水中，因此静止水也可能带电。有触电的风险。心理健康问题
不过，除了急流的水外，洪水带来的最大健康问题可能是心理健康问题，研究表明。
飓风和洪水引发焦虑、抑郁和压力。风暴可能加剧现有心理健康问题或导致新的问题。在任何自然灾害期间和之后，压力和情绪困扰是常见的。哭泣可能变得更容易，睡眠可能困难，担忧或独处的愿望可能特别强烈，思维可能变得混乱，记住事情或听别人说话可能变得困难。专家表示，接受帮助也可能变得困难。一些人可能会因与创伤后应激障碍有关的一系列挑战而产生问题，但大多数受影响的人应该会随着时间的推移恢复。
专家表示，人性具有韧性，大多数人在灾难后能够随着时间的推移适应。那些与家人、朋友和同事有紧密联系的人恢复得最好，因此专家建议密切关注这些关系以帮助加快恢复。对于那些有持续心理问题的人，建议进行咨询。联邦单位提供了灾难困扰热线，帮助那些因风暴而面临心理健康问题的人。